Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
EPB42P16452 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
EPB42P16452 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
EPB42P16452 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPB42P16452 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPB42P16452 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPB42P16452 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
EPB42P16452 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms