Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DEFA4P12838 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms