Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
DCTN3O75935 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
DCTN3O75935 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms