Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTSVO60911 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTSVO60911 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTSVO60911 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTSVO60911 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CTSVO60911 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms