Protein–RNA interactions for Protein: O43324

EEF1E1, Eukaryotic translation elongation factor 1 epsilon-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1E1O43324 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EEF1E1O43324 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
EEF1E1O43324 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms