Protein–RNA interactions for Protein: C9JBD0

KRBOX1, KRAB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBOX1C9JBD0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KRBOX1C9JBD0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms