Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTPDC1A2A3K4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTPDC1A2A3K4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms