Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSZ3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WSZ3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
A0A087WSZ3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms