Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP2-201ENST00000263816 15808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV2-216ENST00000540292 11003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 OR8B9P-202ENST00000642028 5216 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO2-202ENST00000356134 3717 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TENM4-201ENST00000278550 14000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC88A-202ENST00000336838 9505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 PDE4DIP-203ENST00000369349 4677 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC93-201ENST00000319432 6896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC93-202ENST00000376300 6899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 CFAP54-202ENST00000524981 9766 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ATM-201ENST00000278616 13147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB40-204ENST00000404138 8992 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.14
KRTAP4-12Q9BQ66 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1A-203ENST00000442789 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 USP47-203ENST00000399455 7396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 CACHD1-201ENST00000290039 5275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 COL12A1-211ENST00000615798 11579 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161787.1-201ENST00000401543 174 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031848.1-201ENST00000419034 351 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL655P-201ENST00000486087 298 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 AC016876.3-201ENST00000610459 426 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR6778-201ENST00000617912 73 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 SEL1L3-201ENST00000264868 4369 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF716-201ENST00000420713 5197 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 FRMD5-211ENST00000618556 5059 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDH15-233ENST00000621708 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNE1-211ENST00000413186 4860 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PSMB2-202ENST00000621781 4217 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 BCL6-201ENST00000232014 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM47E-202ENST00000502320 6249 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 FHAD1-206ENST00000375998 4355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 AC114324.1-201ENST00000504077 3152 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA2-216ENST00000549396 5363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 FRS2-209ENST00000550389 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF507-201ENST00000311921 7638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 KIF9-AS1-201ENST00000429315 4898 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 NLGN4Y-203ENST00000382868 5338 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAH1-201ENST00000420323 13104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB4-202ENST00000342788 12136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRK-206ENST00000368215 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 NAV2-203ENST00000396085 11000 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP135-201ENST00000257287 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM11-206ENST00000622142 10730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 PJA2-201ENST00000361189 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ASXL2-201ENST00000336112 8889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
KRTAP4-12Q9BQ66 VANGL1-204ENST00000369510 8647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms