Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SRPRBQ9Y5M8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRPRBQ9Y5M8 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms