Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV3

CIZ1, Cip1-interacting zinc finger protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIZ1Q9ULV3 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CIZ1Q9ULV3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CIZ1Q9ULV3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms