Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ9

REV1, DNA repair protein REV1, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV1Q9UBZ9 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
REV1Q9UBZ9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms