Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
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COPS7AQ9UBW8 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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COPS7AQ9UBW8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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COPS7AQ9UBW8 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
COPS7AQ9UBW8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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