Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CC2D2AQ9P2K1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CC2D2AQ9P2K1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms