Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CENPMQ9NSP4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CENPMQ9NSP4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms