Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB2

KRT84, Keratin, type II cuticular Hb4, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT84Q9NSB2 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KRT84Q9NSB2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms