Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SNX15Q9NRS6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms