Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
REPIN1Q9BWE0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms