Protein–RNA interactions for Protein: Q99941

ATF6B, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6BQ99941 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATF6BQ99941 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms