Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SCGB3A2Q96PL1 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SCGB3A2Q96PL1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms