Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM227BQ96M60 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM227BQ96M60 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms