Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PRRC1Q96M27 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PRRC1Q96M27 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms