Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC012309.1-203ENST00000585860 965 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SMIM8-207ENST00000608525 735 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 HIST2H4B-201ENST00000579512 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AL031430.1-201ENST00000642067 1039 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
MS4A3Q96HJ5 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms