Protein–RNA interactions for Protein: Q96FH0

BORCS8, BLOC-1-related complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS8Q96FH0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BORCS8Q96FH0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BORCS8Q96FH0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms