Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RNFT2Q96EX2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms