Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RFT1Q96AA3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RFT1Q96AA3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms