Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
UTP4Q969X6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms