Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVM7

STAG1, Cohesin subunit SA-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG1Q8WVM7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAG1Q8WVM7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAG1Q8WVM7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms