Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SAMD12Q8N8I0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms