Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLD3Q8IV08 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms