Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC174Q6PII3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC174Q6PII3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms