Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LMOD2Q6P5Q4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LMOD2Q6P5Q4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms