Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ETFRF1Q6IPR1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ETFRF1Q6IPR1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms