Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GKAP1Q5VSY0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GKAP1Q5VSY0 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms