Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
KCNT1Q5JUK3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms