Protein–RNA interactions for Protein: Q504Q3

PAN2, PAN2-PAN3 deadenylation complex catalytic subunit PAN2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN2Q504Q3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PAN2Q504Q3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms