Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HFEQ30201 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HFEQ30201 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HFEQ30201 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms