Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKX8

ERCC6L, DNA excision repair protein ERCC-6-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6LQ2NKX8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ERCC6LQ2NKX8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ERCC6LQ2NKX8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms