Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FXNQ16595 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FXNQ16595 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FXNQ16595 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms