Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
CCDC6Q16204 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CCDC6Q16204 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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