Protein–RNA interactions for Protein: Q15572

TAF1C, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1CQ15572 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TAF1CQ15572 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TAF1CQ15572 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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