Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SIX1Q15475 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
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