Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PDE1CQ14123 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PDE1CQ14123 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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