Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
KLF9Q13886 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms