Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CAMK2DQ13557 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms