Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
MSLNQ13421 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
MSLNQ13421 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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