Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.742e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.746e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GPR108-208ENST00000595908 1750 ntTSL 519.65■□□□□ 0.745e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.716e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NBEAL2-210ENST00000477412 827 ntTSL 219.42■□□□□ 0.73e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NBEAL2-209ENST00000476095 959 ntTSL 519.42■□□□□ 0.73e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.696e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NTRK1-208ENST00000531606 642 ntTSL 319.33■□□□□ 0.686e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GRSF1-202ENST00000499044 2491 ntTSL 219.28■□□□□ 0.682e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.676e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TMEM161A-208ENST00000587925 582 ntTSL 319.19■□□□□ 0.666e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GPR108-213ENST00000598626 619 ntTSL 319.09■□□□□ 0.655e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 CCDC61-208ENST00000601763 291 ntTSL 319.06■□□□□ 0.643e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ARHGEF1-211ENST00000595723 872 ntTSL 518.89■□□□□ 0.616e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.575e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PSMD5-AS1-211ENST00000640066 1970 ntTSL 1 (best)18.55■□□□□ 0.566e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GPR108-203ENST00000537722 619 ntTSL 1 (best)18.48■□□□□ 0.555e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GPR108-205ENST00000594500 523 ntTSL 318.48■□□□□ 0.555e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.56e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TMEM222-207ENST00000478104 986 ntTSL 318.02■□□□□ 0.489e-15■■■□□ 19
PABPC4Q13310 C3-213ENST00000600744 708 ntTSL 518.02■□□□□ 0.485e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.476e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RAD9A-204ENST00000535644 1624 ntTSL 317.91■□□□□ 0.466e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.442e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NBEAL2-207ENST00000469349 540 ntTSL 217.34■□□□□ 0.373e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.336e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ARHGEF1-222ENST00000600517 428 ntTSL 316.15■□□□□ 0.186e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 FGFR4-215ENST00000513423 445 ntTSL 216.1■□□□□ 0.176e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PSMD5-AS1-214ENST00000640391 707 ntTSL 215.86■□□□□ 0.136e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RABL6-205ENST00000435930 3328 ntTSL 215.8■□□□□ 0.125e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.112e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.086e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.046e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NTRK1-207ENST00000530298 3052 ntTSL 215.29■□□□□ 0.046e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 BSCL2-212ENST00000449636 545 ntTSL 315.2■□□□□ 0.024e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 BSCL2-213ENST00000463679 881 ntTSL 215.15■□□□□ 0.024e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NCDN-203ENST00000373253 3677 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.052e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GRSF1-204ENST00000505068 3561 ntTSL 214.71□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ARHGEF1-216ENST00000598587 359 ntTSL 214.37□□□□□ -0.116e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GPR108-204ENST00000594034 778 ntTSL 314.3□□□□□ -0.125e-18■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NOA1-201ENST00000264230 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.136e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ALKBH6-209ENST00000471323 3326 ntTSL 214.13□□□□□ -0.152e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NCDN-204ENST00000423723 986 ntTSL 313.89□□□□□ -0.192e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TAF1A-203ENST00000366890 1648 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.284e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RNF213-202ENST00000411702 6428 ntTSL 213.31□□□□□ -0.286e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NCDN-202ENST00000373243 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.292e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TMEM173-206ENST00000507297 3200 ntTSL 213.2□□□□□ -0.31e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 POLR3F-201ENST00000377603 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.426e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 DNAJA2-201ENST00000317089 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TAF1A-202ENST00000352967 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.54e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 POLR3F-203ENST00000462997 2257 ntTSL 1 (best)11.71□□□□□ -0.536e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PPP2R1B-212ENST00000534521 2294 ntTSL 211.65□□□□□ -0.546e-8■■■□□ 19
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PABPC4Q13310 PPP2R1B-201ENST00000311129 2082 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.766e-8■■■□□ 19
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PABPC4Q13310 PPP2R1B-206ENST00000527614 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.836e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TMEM222-209ENST00000498220 679 ntTSL 39.59□□□□□ -0.879e-15■■■□□ 19
PABPC4Q13310 GTF3C3-201ENST00000263956 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.886e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TAF1A-201ENST00000350027 1966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.884e-9■■■□□ 19
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PABPC4Q13310 SCG3-201ENST00000220478 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.075e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RNF213-203ENST00000427003 3552 ntTSL 1 (best)8.36□□□□□ -1.076e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RNF213-210ENST00000560083 4212 ntTSL 27.88□□□□□ -1.156e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.176e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.275e-6■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.312e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.466e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.472e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 APIP-203ENST00000532428 4583 ntTSL 1 (best)5.85□□□□□ -1.472e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.522e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.536e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.612e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 BSCL2-204ENST00000403098 326 ntTSL 54.69□□□□□ -1.664e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 AP5M1-207ENST00000556377 466 ntTSL 34.68□□□□□ -1.662e-11■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PES1-212ENST00000488719 1732 ntTSL 221.23■□□□□ 0.994e-12■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.54e-12■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PES1-208ENST00000441668 999 ntTSL 317.86■□□□□ 0.454e-12■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.374e-12■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PES1-205ENST00000405677 2708 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.114e-12■■■□□ 19
PABPC4Q13310 PES1-203ENST00000402281 2760 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.324e-12■■■□□ 19
PABPC4Q13310 ARFRP1-203ENST00000609188 225 ntTSL 520.64■□□□□ 0.897e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.141e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TTLL4-202ENST00000392102 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.531e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TTLL4-201ENST00000258398 4730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.851e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 TTLL4-210ENST00000442769 3971 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.121e-9■■■□□ 19
PABPC4Q13310 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.531e-8■■■□□ 19
PABPC4Q13310 G6PD-209ENST00000490651 783 ntTSL 221.7■■□□□ 1.066e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 GUK1-234ENST00000492871 1065 ntTSL 331.15■■■□□ 2.582e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 GUK1-235ENST00000493138 694 ntTSL 330.46■■■□□ 2.472e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.292e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.772e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.562e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 GUK1-230ENST00000485838 774 ntTSL 322.37■■□□□ 1.172e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.752e-7■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 SRGN-201ENST00000242465 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.37e-12■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 MAPK1IP1L-205ENST00000622254 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.713e-6■■■□□ 18.9
PABPC4Q13310 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.23e-6■■■□□ 18.9
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