Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SEMA3BQ13214 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SEMA3BQ13214 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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