Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CALCOCO2Q13137 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
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