Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
DUSP4Q13115 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
DUSP4Q13115 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
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